1950年3月，中国人民解放军军需部卫生部接管了汉口天主梅神父医院，中南军区军需部卫生处在此新建军工医院。

 

1951年8月1日正式落成开院。原名为中南军区军工医院，隶属中南军区后勤部，行政由军需部领导，业务由后勤部卫生部领导。

 

1958年 由于军需任务减少，更好发挥医院为社会医疗服务，当年5月，医院移交地方，更名为“武汉市第六医院”。

 

1962年 医院被部队收回，医院名称定为“中国人民解放军总后勤部军需生产部第一职工医院”。

 

1988年 医院被中国人民解放军总后勤部军需生产管理部授予第二院名：“武汉军工医院”。

 

1991年 医院更名为“武汉军工总医院”。

 

1995年 医院通过国家“爱婴医院”评审。

 

1997年 医院被卫生部授予“三级甲等医院”。

 

2002年 医院由军队移交至湖北省政府，隶属湖北省卫生厅管理，更名为“湖北省中山医院”。

 

2004年 伟大的革命先行者孙中山先生嫡孙女孙穗芳博士受聘为医院名誉院长 。

 

2007年 湖北省卫生厅授予医院疼痛科为“湖北省疼痛治疗中心” 。

 

2010年 湖北省卫生厅授予医院神经内科为“湖北省脑卒中筛查及干预基地”。 医院“诚信楼”建成并投入使用。

 

2012年 卫生部授予医院神经内科为“卫生部脑卒中筛查及防治基地”。

 

2013年 医院正式收购武汉市阳逻中心医院，并挂牌“湖北省中山医院阳逻院区”。

 

2014年 医院正式更名为“湖北省第三人民医院”，并保留“湖北省中山医院”院名。